Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM2O43147 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms