Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6AO15550 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KDM6AO15550 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM6AO15550 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms