Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFFAO00273 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFFAO00273 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFFAO00273 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFFAO00273 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFFAO00273 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DFFAO00273 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFFAO00273 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DFFAO00273 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFFAO00273 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFFAO00273 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFFAO00273 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFFAO00273 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DFFAO00273 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DFFAO00273 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DFFAO00273 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DFFAO00273 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DFFAO00273 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DFFAO00273 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DFFAO00273 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DFFAO00273 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DFFAO00273 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DFFAO00273 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DFFAO00273 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DFFAO00273 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DFFAO00273 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DFFAO00273 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DFFAO00273 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DFFAO00273 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DFFAO00273 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DFFAO00273 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DFFAO00273 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DFFAO00273 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DFFAO00273 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DFFAO00273 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DFFAO00273 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DFFAO00273 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DFFAO00273 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DFFAO00273 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DFFAO00273 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DFFAO00273 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DFFAO00273 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DFFAO00273 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DFFAO00273 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DFFAO00273 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DFFAO00273 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DFFAO00273 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DFFAO00273 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DFFAO00273 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DFFAO00273 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DFFAO00273 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DFFAO00273 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DFFAO00273 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DFFAO00273 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DFFAO00273 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DFFAO00273 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DFFAO00273 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DFFAO00273 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DFFAO00273 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DFFAO00273 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DFFAO00273 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DFFAO00273 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DFFAO00273 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DFFAO00273 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DFFAO00273 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DFFAO00273 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DFFAO00273 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DFFAO00273 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DFFAO00273 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DFFAO00273 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DFFAO00273 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DFFAO00273 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DFFAO00273 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms