Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF10AO00220 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms