Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms