Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMO7DNF2Z398 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms