Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms