Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4E1Z4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4E1Z4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4E1Z4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4E1Z4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4E1Z4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4E1Z4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4E1Z4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4E1Z4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4E1Z4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4E1Z4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
B4E1Z4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4E1Z4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4E1Z4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4E1Z4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4E1Z4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4E1Z4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4E1Z4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4E1Z4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4E1Z4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4E1Z4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4E1Z4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4E1Z4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4E1Z4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4E1Z4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4E1Z4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4E1Z4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4E1Z4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4E1Z4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4E1Z4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4E1Z4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4E1Z4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4E1Z4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4E1Z4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4E1Z4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4E1Z4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4E1Z4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4E1Z4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
B4E1Z4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4E1Z4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4E1Z4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4E1Z4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4E1Z4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4E1Z4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4E1Z4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4E1Z4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4E1Z4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4E1Z4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4E1Z4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4E1Z4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
B4E1Z4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
B4E1Z4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
B4E1Z4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
B4E1Z4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
B4E1Z4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
B4E1Z4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
B4E1Z4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
B4E1Z4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
B4E1Z4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
B4E1Z4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
B4E1Z4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4E1Z4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4E1Z4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4E1Z4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4E1Z4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4E1Z4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4E1Z4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
B4E1Z4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4E1Z4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4E1Z4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4E1Z4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4E1Z4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
B4E1Z4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4E1Z4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4E1Z4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4E1Z4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4E1Z4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4E1Z4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4E1Z4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4E1Z4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4E1Z4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
B4E1Z4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4E1Z4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4E1Z4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4E1Z4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4E1Z4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4E1Z4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4E1Z4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4E1Z4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4E1Z4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4E1Z4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4E1Z4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4E1Z4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4E1Z4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4E1Z4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4E1Z4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4E1Z4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4E1Z4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E1Z4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E1Z4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms