Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYSRT1A8MQ03 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYSRT1A8MQ03 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CYSRT1A8MQ03 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYSRT1A8MQ03 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYSRT1A8MQ03 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CYSRT1A8MQ03 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYSRT1A8MQ03 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYSRT1A8MQ03 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYSRT1A8MQ03 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYSRT1A8MQ03 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYSRT1A8MQ03 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYSRT1A8MQ03 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYSRT1A8MQ03 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYSRT1A8MQ03 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYSRT1A8MQ03 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYSRT1A8MQ03 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms