Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NNZ2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NNZ2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NNZ2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NNZ2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NNZ2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NNZ2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NNZ2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NNZ2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NNZ2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NNZ2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NNZ2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NNZ2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NNZ2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NNZ2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NNZ2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NNZ2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NNZ2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NNZ2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NNZ2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NNZ2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NNZ2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NNZ2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NNZ2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NNZ2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NNZ2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NNZ2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NNZ2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NNZ2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NNZ2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NNZ2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NNZ2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NNZ2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NNZ2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NNZ2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NNZ2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NNZ2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NNZ2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NNZ2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NNZ2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NNZ2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NNZ2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NNZ2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NNZ2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NNZ2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NNZ2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NNZ2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NNZ2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NNZ2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NNZ2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NNZ2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NNZ2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NNZ2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NNZ2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NNZ2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NNZ2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NNZ2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NNZ2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NNZ2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNZ2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNZ2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNZ2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNZ2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNZ2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNZ2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNZ2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNZ2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNZ2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNZ2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNZ2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A6NNZ2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A6NNZ2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NNZ2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NNZ2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NNZ2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NNZ2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NNZ2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NNZ2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NNZ2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NNZ2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NNZ2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NNZ2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NNZ2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NNZ2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NNZ2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NNZ2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NNZ2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NNZ2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NNZ2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NNZ2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NNZ2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NNZ2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NNZ2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NNZ2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NNZ2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NNZ2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NNZ2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NNZ2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NNZ2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NNZ2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms