Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DBX1A6NMT0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms