Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms