Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEMA6NI47 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEMA6NI47 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms