Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP2A6NFY4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms