Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP17L4A6NCW7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms