Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PSDA5PKW4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms