Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SEW6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SEW6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0D9SEW6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0D9SEW6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0D9SEW6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0D9SEW6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0D9SEW6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0D9SEW6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0D9SEW6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0D9SEW6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0D9SEW6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0D9SEW6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0D9SEW6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms