Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms