Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PTGS1-201ENST00000223423 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TYRO3P-201ENST00000558165 2705 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TAF1C-203ENST00000541676 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SOX9-201ENST00000245479 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ACIN1-223ENST00000605057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 NMUR2-201ENST00000255262 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LINC00473-205ENST00000584911 2212 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RPS6KB1-202ENST00000393021 5479 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MAB21L2-201ENST00000317605 2772 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CNBD2-204ENST00000489667 2531 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RNF10-203ENST00000413266 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 KCNB1-201ENST00000371741 11879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 EFCAB13-201ENST00000331493 3931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZNF550-205ENST00000457177 3376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZNRD1ASP-219ENST00000448093 2296 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AR-202ENST00000396043 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC245884.11-201ENST00000616950 1734 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 DAPK2-213ENST00000612884 8086 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PACSIN1-201ENST00000244458 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PACSIN1-202ENST00000374043 4229 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RAPGEF3-219ENST00000549151 3265 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LINC00923-201ENST00000503768 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 POLN-201ENST00000382865 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AFG3L1P-214ENST00000454997 3327 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF15-201ENST00000361926 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 G3BP2-201ENST00000357854 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LINC01597-201ENST00000380888 4472 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FCRL1-201ENST00000358292 2778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SLC3A1-202ENST00000409229 2909 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CDYL-202ENST00000343762 3241 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 KIAA1683-206ENST00000600328 3819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CETP-202ENST00000379780 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TPT1-212ENST00000530705 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 NPC1L1-201ENST00000289547 5048 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SPRYD3-204ENST00000547837 1655 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LINC00840-201ENST00000431737 1974 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PRR19-202ENST00000499536 1956 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 NRXN3-217ENST00000634499 6069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ACSBG2-202ENST00000586696 2739 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CPSF3-202ENST00000460593 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SEH1L-201ENST00000262124 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ELOVL7-201ENST00000425382 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RPL13AP17-204ENST00000450028 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CELF5-203ENST00000541430 4268 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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