Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AL390728.4-202ENST00000606173 430 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 IFI27-212ENST00000618863 505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC093323.3-201ENST00000632627 949 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 RN7SK-201ENST00000636484 328 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 PARVA-201ENST00000334956 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 HSD3B1-201ENST00000369413 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 NAA50-203ENST00000477813 1945 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SNAP25-201ENST00000254976 2053 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 NDRG4-254ENST00000569923 1312 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC079880.1-201ENST00000603040 2046 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 HIST1H1E-201ENST00000304218 754 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SPANXD-201ENST00000370515 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AL391987.4-201ENST00000377547 439 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 CST13P-202ENST00000400563 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC006022.1-201ENST00000425261 388 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 PRSS3-204ENST00000429677 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AL357060.2-204ENST00000448942 963 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 RN7SL186P-201ENST00000466485 297 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC011005.1-201ENST00000467614 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 RN7SL386P-201ENST00000485776 297 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 RN7SL265P-201ENST00000486808 300 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 RN7SL454P-201ENST00000492744 243 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC010280.2-201ENST00000507733 410 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AP003717.2-201ENST00000534962 898 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AL391152.1-202ENST00000551408 624 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 HNRNPA1P62-201ENST00000559372 952 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 FANCI-214ENST00000567996 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 RN7SL322P-201ENST00000583519 299 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC006449.2-201ENST00000618407 486 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 TNNT3-216ENST00000641119 941 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ELOVL1-202ENST00000413844 1451 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 GABPB1-206ENST00000543881 1450 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 FRMD6-204ENST00000553556 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 CT55-202ENST00000344129 1728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SNX1-211ENST00000560829 1869 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 CHI3L2-201ENST00000369744 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SUPT3H-201ENST00000371458 728 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC211485.1-201ENST00000417100 1107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 RN7SL756P-201ENST00000488739 268 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 RBPMS-205ENST00000517860 1076 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC087699.1-201ENST00000558111 393 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 APOC1P1-202ENST00000571466 253 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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