Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 IP6K1-201ENST00000321599 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LMO3Q8TAP4 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LMO3Q8TAP4 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LMO3Q8TAP4 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LMO3Q8TAP4 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LMO3Q8TAP4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LMO3Q8TAP4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LMO3Q8TAP4 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LMO3Q8TAP4 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LMO3Q8TAP4 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LMO3Q8TAP4 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LMO3Q8TAP4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LMO3Q8TAP4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LMO3Q8TAP4 SLURP1-201ENST00000246515 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 LRRC2-201ENST00000296144 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 TSPEAR-AS2-201ENST00000330490 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 TOMM5-202ENST00000377773 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 FAM90A22P-201ENST00000400142 1395 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 HMGB3P4-201ENST00000428776 514 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC004951.1-201ENST00000447643 1866 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 VDAC1P13-201ENST00000447826 859 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 NPIPP1-202ENST00000534799 1214 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ZNF226-212ENST00000588795 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ZNF221-205ENST00000622072 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 C11orf1-201ENST00000260276 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 LINC00923-201ENST00000503768 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SNAI1-201ENST00000244050 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 OR6F1-203ENST00000641444 1698 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PTPRD-AS2-201ENST00000429581 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CRYBB2-201ENST00000398215 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CYP2F2P-201ENST00000437853 1056 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 TNFAIP3-209ENST00000619035 2267 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PDHA1-206ENST00000422285 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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