Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 U3.49-201ENST00000391065 214 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 APOBEC3H-204ENST00000442487 988 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PRDM2-214ENST00000505823 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 C12orf80-202ENST00000551894 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 DHRS4L1-201ENST00000558293 855 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC027237.4-201ENST00000560870 694 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 KRTAP10-9-203ENST00000616529 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PRSS2-204ENST00000632805 807 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 MAGEB1-202ENST00000397548 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 TRPC3-205ENST00000513531 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 FAM98A-202ENST00000403368 2818 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PRAMEF12-201ENST00000357726 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 KIR3DL2-202ENST00000326321 1877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 KRT8P15-201ENST00000425226 1451 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 LRRC2-201ENST00000296144 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CCL26-202ENST00000394905 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC092587.1-201ENST00000410042 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 MAPT-207ENST00000420682 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PTPN2P2-201ENST00000433704 1024 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AL355309.1-201ENST00000442158 78 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PLA2G6-213ENST00000447598 567 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RPLP0P2-204ENST00000490750 961 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC005355.1-201ENST00000513329 714 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AP001922.3-201ENST00000524768 842 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 MORF4L1-208ENST00000558746 874 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC006111.1-201ENST00000573982 329 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 snoZ6.3-201ENST00000583496 76 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 MIR4761-201ENST00000585066 82 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SMIM17-202ENST00000600547 573 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AL157791.2-201ENST00000604758 478 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PUDPP2-202ENST00000628080 737 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 IFT74-201ENST00000380062 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ARSG-202ENST00000452479 1733 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CLEC17A-203ENST00000547437 2065 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 WDR78-201ENST00000371022 1520 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ALDOC-202ENST00000395319 1519 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CXorf40B-201ENST00000355203 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 MYL5-201ENST00000400159 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AGAP13P-201ENST00000417888 363 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 LINC00337-202ENST00000441724 1138 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 LILRB1-AS1-201ENST00000456337 554 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SOX2-OT-201ENST00000460739 609 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PTDSS1-206ENST00000522072 1112 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ZNF970P-201ENST00000547456 223 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 HPR-203ENST00000561690 634 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC005086.1-201ENST00000566572 801 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC124319.1-201ENST00000576808 653 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms