Protein–RNA interactions for Protein: Q96S21

RAB40C, Ras-related protein Rab-40C, humanhuman

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40CQ96S21 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PCDHA9-201ENST00000378122 6900 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PCBP2-201ENST00000359282 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 KBTBD6-201ENST00000379485 5178 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 LINGO1-AS1-201ENST00000558691 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SALL2-207ENST00000614342 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 GOLGA6L10-208ENST00000619556 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TRIM40-206ENST00000376724 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AL357509.1-201ENST00000641892 2013 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC092117.2-201ENST00000623937 1659 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ZKSCAN3-201ENST00000252211 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ANKRD30BP2-202ENST00000447861 3260 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 FO681491.1-201ENST00000623586 3260 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 NMT2-202ENST00000378165 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 RAI2-202ENST00000360011 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 UGT1A3-201ENST00000482026 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CACNA1C-204ENST00000347598 6655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ABCB8-222ENST00000542328 4371 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 RHBDL3-203ENST00000536287 4470 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 RAB5B-211ENST00000628569 496 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 GAL3ST4-203ENST00000413800 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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