Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 NELL2-203ENST00000429094 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC026369.2-201ENST00000540136 1101 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TRIM31-210ENST00000376734 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 INTS8-217ENST00000523731 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 LIF-201ENST00000249075 3969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 COQ5-201ENST00000288532 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 DRD3-204ENST00000467632 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TMEM225BP0DP42 ACSL6-207ENST00000379264 6539 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TMEM225BP0DP42 SCN3B-206ENST00000530277 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TMEM225BP0DP42 STRADA-202ENST00000336174 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TMEM225BP0DP42 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TMEM225BP0DP42 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TMEM225BP0DP42 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TMEM185A-210ENST00000613273 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 DUSP16-201ENST00000228862 3402 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SPRY4-201ENST00000344120 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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