Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 UBE2A-210ENST00000630695 1771 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 HTR3E-206ENST00000440596 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 OR13A1-202ENST00000536058 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 HSD3B1-201ENST00000369413 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 BHLHB9P1-201ENST00000553845 1651 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PCYT1A-206ENST00000431016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CCNH-203ENST00000504878 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC079880.1-201ENST00000603040 2046 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC009927.1-201ENST00000510501 1779 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AP4S1-203ENST00000334725 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AL157414.1-201ENST00000366097 770 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 IGLV3-22-201ENST00000390307 409 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC211485.1-201ENST00000417100 1107 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 TIMM23B-202ENST00000451577 1152 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC245164.1-201ENST00000517731 412 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 RBPMS-205ENST00000517860 1076 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ACTG1P16-201ENST00000564713 1082 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC004134.1-201ENST00000587835 225 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC092471.2-201ENST00000637219 651 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PCYT1B-202ENST00000379144 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 MOCS1P1-201ENST00000564020 1612 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 LINC00339-201ENST00000404210 1189 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ACTBP1-201ENST00000417985 1113 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 LINC01287-203ENST00000454441 1007 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC026785.1-201ENST00000505520 580 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 MEF2C-AS1-205ENST00000509179 388 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 POU5F1-205ENST00000512818 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 DHDDS-216ENST00000525682 1235 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AP001107.8-201ENST00000530805 479 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AL355075.5-201ENST00000553568 890 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ZBTB25-203ENST00000555424 565 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC008013.1-201ENST00000612219 629 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC012486.1-201ENST00000625143 216 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 LINC00339-213ENST00000642137 222 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 GRB10-202ENST00000357271 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ARSF-201ENST00000359361 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ZWILCH-209ENST00000565627 1845 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms