Protein–RNA interactions for Protein: Q96S21

RAB40C, Ras-related protein Rab-40C, humanhuman

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40CQ96S21 C16orf78-201ENST00000299191 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ASPH-208ENST00000517856 6337 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TSC22D3-206ENST00000372397 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CACNA1G-204ENST00000359106 7648 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC134682.1-201ENST00000569285 3377 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 DERL1-202ENST00000405944 1994 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SPATA13-205ENST00000409126 2111 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 FOSB-204ENST00000585836 3550 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 GNB5-201ENST00000261837 8906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC084855.2-201ENST00000559400 2393 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TNS2-204ENST00000546602 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SLC37A1-202ENST00000398341 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 RAET1K-202ENST00000533735 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PCGF2-204ENST00000616199 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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