Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms