Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4M8

LINC00588, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00588, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00588Q9Y4M8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00588Q9Y4M8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00588Q9Y4M8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms