Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y467

SALL2, Sal-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL2Q9Y467 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SALL2Q9Y467 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL2Q9Y467 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms