Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms