Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF330Q9Y3S2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms