Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
REXO2Q9Y3B8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REXO2Q9Y3B8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REXO2Q9Y3B8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REXO2Q9Y3B8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
REXO2Q9Y3B8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REXO2Q9Y3B8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REXO2Q9Y3B8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REXO2Q9Y3B8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REXO2Q9Y3B8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REXO2Q9Y3B8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
REXO2Q9Y3B8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REXO2Q9Y3B8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REXO2Q9Y3B8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REXO2Q9Y3B8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REXO2Q9Y3B8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REXO2Q9Y3B8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms