Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP11Q9Y3A2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms