Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms