Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL20Q9Y2M5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL20Q9Y2M5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL20Q9Y2M5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL20Q9Y2M5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL20Q9Y2M5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL20Q9Y2M5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms