Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD4BQ9Y2L6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMD4BQ9Y2L6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD4BQ9Y2L6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD4BQ9Y2L6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD4BQ9Y2L6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD4BQ9Y2L6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD4BQ9Y2L6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD4BQ9Y2L6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD4BQ9Y2L6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD4BQ9Y2L6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms