Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms