Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms