Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms