Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms