Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TRAK1Q9UPV9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAK1Q9UPV9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAK1Q9UPV9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAK1Q9UPV9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAK1Q9UPV9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAK1Q9UPV9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAK1Q9UPV9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAK1Q9UPV9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAK1Q9UPV9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAK1Q9UPV9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAK1Q9UPV9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAK1Q9UPV9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAK1Q9UPV9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAK1Q9UPV9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAK1Q9UPV9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAK1Q9UPV9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms