Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM35Q9UPQ4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms