Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF18Q9UNG2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms