Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
L1RE1Q9UN81 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms