Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF19Q9UMS4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF19Q9UMS4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF19Q9UMS4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF19Q9UMS4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF19Q9UMS4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF19Q9UMS4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF19Q9UMS4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF19Q9UMS4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF19Q9UMS4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF19Q9UMS4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF19Q9UMS4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF19Q9UMS4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF19Q9UMS4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF19Q9UMS4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF19Q9UMS4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF19Q9UMS4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF19Q9UMS4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms