Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PALD1Q9ULE6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALD1Q9ULE6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms