Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms