Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms