Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAV3Q9UKW4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAV3Q9UKW4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAV3Q9UKW4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAV3Q9UKW4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAV3Q9UKW4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAV3Q9UKW4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAV3Q9UKW4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAV3Q9UKW4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAV3Q9UKW4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAV3Q9UKW4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAV3Q9UKW4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAV3Q9UKW4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAV3Q9UKW4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAV3Q9UKW4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAV3Q9UKW4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAV3Q9UKW4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms