Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms